俄罗斯《BKO空天防御》杂志曾撰文指出，从独联体国家举行的一系列反导演习的情况中可以看出，今后俄罗斯及其独联体伙伴国所认定的导弹威胁主要来自“西方”和“南方”。该刊进而认为，“西方”的威胁主要来自美国和北约，“南方”的威胁主要来自外高加索和中亚方向，它们影响到独联体国家边界的稳定，外界普遍认为这一威胁来自积极发展远程导弹的伊朗和巴基斯坦两国，不过基于俄罗斯与两国尚存的友好关系，俄军事政策制定者不认为这种威胁迫在眉睫。

　　这种认识直接导致了JCAS在力量配比上形成“西强南弱”的格局。据透露，JCAS的欧洲方向防空统一体系基本组建完毕，这一体系由白俄罗斯、俄罗斯位于波兰和立陶宛之间的飞地加里宁格勒州和俄罗斯西部地区组成。2005年6月至7月间，俄罗斯向白俄罗斯转交了3个营的S-300防空导弹系统，并已投入战斗执勤，这使得北约在波兰到波罗的海三国区域内的任何军事行动都受到严密监视。俄罗斯还希望推动在高加索和中亚分别建立独联体国家防空体系的地区指挥机构，不过这一建议遭到部分国家的反对，它们担心这会导致本国主权的流失。

　　从技术角度看，JCAS所遇到的最大困难是独联体各国以导弹早期预警、情报分析和作战指挥为代表的C4ISR系统的落后和不匹配。目前，大多数JCAS参与国仍沿用前苏联遗留的“涅瓦河”、“贝加尔”和“宇宙”C3I系统，许多系统的操作语言都换成本国语言或英语，而俄罗斯空军开始换装的“奥斯诺瓦”（Osnova）自动化指挥系统却不能与之兼容，这令外界对JCAS能发挥多大功效存在疑问。