自２０世纪５０年代中期以来，苏丹南北方因在民族、宗教、文化和政治等方面存在差异，矛盾不断激化，并引发了两次内战。

　　１９５５年，苏丹第一次内战爆发。１９７２年３月，苏丹政府与南方代表签订协议，结束持续１７年之久的内战，南方实行自治。

　　２０世纪８０年代初，苏丹总统尼迈里在全国实行伊斯兰法，引起南方人的强烈抗议。以约翰·加朗为首的一些南方官兵于１９８３年５月发动兵变，成立“苏丹人民解放军”，开始从事武力推翻政府的活动，并引发第二次内战。

　　２００５年１月９日，苏丹政府和苏丹人民解放运动在肯尼亚首都内罗毕签署全面和平协议，从而结束了苏丹北南之间长达２０多年的第二次内战。

　　根据该和平协议，苏丹南部地区将在２０１１年１月９日举行公投，以决定该地区是否从苏丹分离。与此同时，位于北南分界线中段的阿卜耶伊地区也将举行公投，以决定该地区属于南方还是北方。