今年2月底和3月初，上海市第五人民医院呼吸科主任揭志军在诊疗过程中发现一例不明原因重症肺炎患者，他以课题标本形式将该病例标本送至市公共卫生临床中心进行重点检测。接到标本后，复旦大学上海医学院医学分子病毒学重点实验室主任袁正宏研究员和市公共卫生临床中心实验室主任胡芸文，带领团队开展了病原学筛查和致病原鉴定，并推测此病毒可能是一种新型流感病毒。
3月22日，市公共卫生临床中心实验室向中国疾病预防控制中心送检病例标本，实验结果得到复核和确认。3月29日，中国疾病预防控制中心从患者的标本中分离到H7N9禽流感病毒。3月31日，国家卫生和计划生育委员会正式通报此次人感染H7N9禽流感病毒是全球首次发现的新亚型流感病毒。该论文表示，新的重配H7N9禽流感病毒的流行潜力不能低估。
