卡里莫夫1990年3月当选为乌兹别克苏维埃社会主义共和国总统。1991年8月31日，乌兹别克斯坦共和国宣布独立。同年12月，卡里莫夫当选为独立后的乌兹别克斯坦共和国首任总统。1995年3月，乌全民公决决定延长他的任期至2000年。2000年1月，卡里莫夫在总统选举中获胜连任。2007年12月，卡里莫夫在总统选举中胜选连任。2015年3月，卡里莫夫在总统选举中再次胜选连任。　　

　　卡里莫夫是中亚政坛的“常青树”，曾多次访华，并于2001年、2006年和2012年来华出席上海合作组织峰会，2008年来华出席北京奥运会开幕式，2014年来华出席亚信峰会，2015年来华出席中国人民抗日战争暨世界反法西斯战争胜利70周年纪念活动。