全国抗战爆发后，谢祥军进入抗日军政大学学习。1939年秋到皖南，历任新四军军部教导总队科长、江北指挥部教导大队副大队长、军政干部学校教育长、抗大第5分校教育长、华中抗大总分校教育长、新四军军部特务团团长、抗大第5分校校长等职，为新四军培养和输送了大批军政干部。

　　解放战争时期，谢祥军先后任华中军区第5、第9军分区司令员，华中野战军第10纵队司令员。1946年夏，他率部参加苏中战役（亦称苏中七战七捷），取得重大战果。同年10月，华中野战军主力在废黄河两岸地区组织了大规模的涟水保卫战。10纵队有3个团参加战斗，其主要任务是阻击敌人从两淮进攻，谢祥军与政委刘培善率广大指战员道道阻击，层层设障，予敌以重大打击，胜利完成任务，有力配合了整个战役。10月24日晨，谢祥军在前沿阵地察看敌情时，不幸被敌人流弹击中，在送往后方医院途中牺牲，年仅32岁。

　　据新华社武汉4月16日电