《魁拔2》延续了首部的故事情节，主人公蛮吉和蛮大人历经磨难之后登上开往涡流岛的曲境一号，随神圣联军一起踏上征讨魁拔之路。同时，魁拔忠实的追随者们已在涡流岛做好了迎接新一代魁拔首领的准备，更完成了魔鬼式布防。