与“国家版”学位证书相比，“清华版”学位证书不再使用国徽图案，改为清华大学校徽图案，证书正文中由现版“依据《中华人民共和国学位条例》”授予学位改为“依据《清华大学章程》”授予学位。“清华版”学位证书采用竖版A4纸大小，便于携带和复印。

　　以往清华大学与国外高水平大学联合培养研究生的学位项目，都会遇到双方共授学位的难题。由于清华只能使用“国家版”学位证书，上面只有中华人民共和国国徽，没有清华校徽，而国外高校通常使用本校的学位证书，共授学位的时候二者很难兼容。清华自主设计学位证书后问题迎刃而解。