九一八事变发生后,魏拯民被党组织派往东北工作,曾任中共哈尔滨市道外区委书记、市委书记。后被派往东满,任中共东满特委书记,参与领导创建东北人民革命军第2军,任政治委员。1935年夏赴莫斯科参加共产国际第七次代表大会。回国后,魏拯民任东满省委书记、东北抗日联军第2军政治委员。他曾同军长王德泰指挥所部北上牡丹江地区和远征南满地区,打通与吉东和南满的联系,与抗联兄弟部队配合作战,扩大了抗日游击区。1936年7月后,魏拯民任中共南满省委书记、东北抗联第1路军总政治部主任、第1路军副总司令,与第1路军总司令兼政治委员杨靖宇指挥所部在辉南、抚松、濛江(今靖宇)、金川、桦甸等地打击敌军,挫败日伪军多次大规模“讨伐”。
1939年冬,东北抗日游击战争的形势更加严峻,魏拯民积劳成疾。1940年2月杨靖宇牺牲后,工作重担全部落在魏拯民肩上。他拖着病体,率部坚持艰苦卓绝的斗争。这年冬天,他病情加重,不能随军行动,只好到长白山区的抗联密营中休养。他常常昼夜不停地起草文件、书写报告、总结经验。在极端困难的条件下,鼓励同志们坚定信心。由于敌人封锁,他只能靠吃树皮、松子和蘑菇等度日,于1941年3月8日病逝,年仅32岁。直到新中国成立后,家人才得知他已牺牲的消息。
据新华社太原12月20日电