然而自上世纪60年代以来，由于扬子鳄栖息地的改变和人类生产活动的影响，野生扬子鳄种群几近灭绝。目前，仅有不超过130条野生扬子鳄分布在安徽省南部已破碎化的生境中，崇明已难觅野生扬子鳄。