2007年10月,时任总统穆沙拉夫下令军方攻击首都伊斯兰堡武装人员盘踞的“红色清真寺”,宗教极端领袖加齐在军事行动中死亡。加齐的儿子提出申诉,高等法院命令伊斯兰堡警方以谋杀罪名对穆沙拉夫立案。
穆沙拉夫如今因牵扯三起案件遭软禁,分别是前总理贝·布托2007年遇刺案、2006年军事行动致死一名部族长老案、2007年实施紧急状态并解除60名最高法院和高等法院法官职务案。