2011年2月,穆巴拉克被迫辞职后,武装部队最高委员会接管了国家权力,解散议会并中止宪法。埃及由此进入军方掌管的过渡期。
在军方执掌的过渡期内,埃及先后完成宪法修正案公投、议会选举和总统选举,并根据过渡计划于2012年6月30日向民选总统穆尔西移交权力,完成权力交接。
尽管穆尔西上台打破了埃及自1952年以来均由军方人士担任总统的传统,但长期以来军方渗透在司法、行政等各个领域的影响力依然根深蒂固。
为扩大自己的影响力,穆尔西上台伊始便频频出手。首先,他颁布总统令,宣布重启被军方解散的人民议会。随后,他利用西奈半岛士兵遇袭事件对军方高层进行人事调整。他还下令取消军方曾颁布的严格限制总统职权的补充宪法声明,颁布新的宪法声明,收回立法权。
在与军方的明争暗斗中,虽互有进退,但穆尔西始终无法撼动军方的潜在影响力。 王龙琴