巴基斯坦官员指认阿夫里迪受美国中情局指派,在开伯尔—普什图省阿伯塔巴德镇以推广乙肝疫苗接种为名收集脱氧核糖核酸(DNA)样本,查找本·拉丹下落。2011年5月,美国派特种部队突袭阿伯塔巴德一处住所,打死本·拉丹。
阿夫里迪否认协助美方收集情报,但美国前国防部长帕内塔2012年承认阿夫里迪所扮演角色。巴基斯坦法院同年5月裁定阿夫里迪“叛国罪”等罪名成立,判处他33年监禁和3500美元罚款。就阿夫里迪的获罪原因,虽然法院称是因他关联非法军事组织“伊斯兰军”而非效力中情局,但美方坚称这是巴方对阿夫里迪助美追踪本·拉丹的报复。