总统府方面认为，应由代理总统黄教安将有关资料依法指定为总统档案。在野党则认为，在归档过程中，可能发生删除、销毁和泄露，可能有人蓄意消灭“亲信干政门”证据。

　　青瓦台一般在总统卸任6个月前把总统档案分门别类，在总统任期结束前，移交至国家档案院，但由于此次出现前所未有的总统遭弹劾下台，因此国家档案院13日宣布，已提前着手归档。

　　国家档案院认为，总统档案的指定主体为总统，包括代理总统和候任总统。总统府方面也认为代理总统黄教安有权指定总统档案。但是问题在于档案指定工作与“亲信干政门”调查取证相冲突。

　　在检方将对朴槿惠进行调查的情况下，有关资料可能成为调查对象，若被指定为总统档案将引发争议。在野党方面甚至敦促检方立刻搜查青瓦台，保全“亲信干政门”证据。