3月上旬开始，本市医疗卫生机构对相关病例及时开展了实验室筛查，科研人员于3月20日初步认为患者可能感染新型流感病毒，3月21日报告市卫生行政部门。3月22日由上海市疾控中心将标本送中国疾病预防控制中心。3月29日下午，中国疾病预防控制中心从送检的病例标本中分离到H7N9禽流感病毒。