轨交13号线一期工程共设14座车站，全部为地下站，分别是华江路站、金沙江西路站、丰庄站、祁连山南路站、真北路站、大渡河路站、金沙江路站、隆德路站、武宁路站、长寿路站、江宁路站、汉中路站、自然博物馆站、南京西路站。可通过金沙江路站(3、4号线）、长寿路站(7号线)和隆德路站(11号线北段一期)换乘进入浦东，分流2号线运营压力。